Научная программа
Школа пройдет в конференц-зале Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН
Новосибирск, пр-т Ак. Лаврентьева 8, конференц-зал
С собой желательно иметь ноутбук.
PDF программы школы
19 июля, 9:30
-
Illumina workshop
Антон Цыганов-Бодунов, Illumina, Англия
- Data Analysis Overview
- Experimental design
- Introduction to Illumina Experiment Manager
- MiSeq Workflows
- Run folders and output files
- MiSeq Run Monitoring
- Intro to MSR & Workflow reports
- Intro to data analysis exercise (output files review and IGV demonstration)
- BaseSpace Exercise
- Variant Studio demonstration
20 июля
Для работы нужно установить на ноутбук CLC Genomics Workbench. Очень желательно, чтобы была 64-bit ОС: Win, Mac, Linux
- Introductory presentation: products, applications, and recently released tools;
- Installation of Genomics Workbench, basics of data navigation;
- Hands-on (Data import, working in tracks, resequencing, de novo assembly);
- RNA-Seq.
-
Эволюция методов определения нуклеотидных последовательностей: от 1kB до генома
Игорь Морозов, ИХБФМ СО РАН, ЦКП "Геномика" СО РАН, Новосибирск
-
Применение новых сиквенсных технологий на практике
Алла Лапидус, ЦГБ СПБГУ, Санкт-Петербург
-
Простой способ собрать геном за полчаса
Андрей Пржибельский, СПбАУ РАН, Санкт-Петербург
21 июля
-
Новые инструменты для создания геномных библиотек
Денис Дмитриенко, Диаэм, Москва
-
Аннотация и анализ эукариотических геномов
Игорь Григорьев, DOE Joint Genome Institute, США
-
Новые подходы к de novo секвенированию сложных геномов
Крутовский Константин Валерьевич, Georg-August-University of Göttingen, Германия
-
Планирование и получение новой информации по метагеномному проекту: заметки к анализу завершенных проектов
Людмила Чистосердова, University of Washington, США
-
Применение технологии парных фрагментов при сборке бактериальных геномов
Елена Кострюкова, Александр Манолов, НИИ Физико-Химической Медицины ФМБА, Москва
-
16S профилирование - от почвы до кишечника
Александр Тяхт, НИИ Физико-Химической Медицины ФМБА, Москва