Научная программа

Школа пройдет в конференц-зале Института химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН

Новосибирск, пр-т Ак. Лаврентьева 8, конференц-зал

С собой желательно иметь ноутбук.

 

PDF программы школы

19 июля, 9:30

  • Illumina workshop
    Антон Цыганов-Бодунов, Illumina, Англия

- Data Analysis Overview
- Experimental design
- Introduction to Illumina Experiment Manager

- MiSeq Workflows
- Run folders and output files
- MiSeq Run Monitoring
- Intro to MSR & Workflow reports
- Intro to data analysis exercise (output files review and IGV demonstration)
- BaseSpace Exercise
- Variant Studio demonstration

20 июля

Для работы нужно установить на ноутбук CLC Genomics Workbench. Очень желательно, чтобы была 64-bit ОС: Win, Mac, Linux

- Introductory presentation: products, applications, and recently released tools;

- Installation of Genomics Workbench, basics of data navigation;

- Hands-on (Data import, working in tracks, resequencing, de novo assembly);

- RNA-Seq.

  • Эволюция методов определения нуклеотидных последовательностей: от 1kB до генома
    Игорь Морозов, ИХБФМ СО РАН, ЦКП "Геномика" СО РАН, Новосибирск
  • Применение новых сиквенсных технологий на практике
    Алла Лапидус, ЦГБ СПБГУ, Санкт-Петербург
  • Простой способ собрать геном за полчаса
    Андрей Пржибельский, СПбАУ РАН, Санкт-Петербург

21 июля

  • Новые инструменты для создания геномных библиотек
    Денис Дмитриенко, Диаэм, Москва
  • Аннотация и анализ эукариотических геномов
    Игорь Григорьев, DOE Joint Genome Institute, США
  • Новые подходы к de novo секвенированию сложных геномов
    Крутовский Константин Валерьевич, Georg-August-University of Göttingen, Германия
  • Планирование и получение новой информации по метагеномному проекту: заметки к анализу завершенных проектов
    Людмила Чистосердова, University of Washington, США
  • Применение технологии парных фрагментов при сборке бактериальных геномов
    Елена Кострюкова, Александр Манолов, НИИ Физико-Химической Медицины ФМБА, Москва
  • 16S профилирование - от почвы до кишечника
    Александр Тяхт, НИИ Физико-Химической Медицины ФМБА, Москва