Novosibirsk, Russia, May, 30 – June, 4, 2011

International Conference
"Modern Problems of Applied Mathematics and Mechanics: Theory, Experiment and Applications", devoted to the 90th anniversary of professor Nikolai N. Yanenko

Volkova E.   Моисеев К.В.  

Численное моделирование полимеразной цепной реакции для различных профилей поля скоростей

Reporter: Volkova E.

     Для быстрой и точной диагностики заболеваний в настоящее время наиболее широко используют полимеразную цепную реакцию (ПЦР). Это перспективный способ увеличения количества исходных ДНК. Реакция протекает при нагревании водного раствора, содержащего двунитевые исходные ДНК, короткие специфичные фрагменты ДНК (праймеры) и полимеразу. Выделяют три этапа ПЦР: денатурация, при которой двунитевые ДНК разделяются на однонитевые; отжиг, во время которого праймеры связываются с концами однонитевых ДНК; элонгация, во время которой образуется две новые копии исходных ДНК.
     В данной работе исследуется ПЦР при различных режимах конвекции в ячейке Релея Бенара. Уравнения изменения концентраций компонентов смеси учитывают концентрации однонитевых, отожженных и двунитевых ДНК, интенсивность изменения концентрации компонентов за счет фазовых переходов, конвективное и диффузионное числа Дамкелера. Числа Дамкелера определяют отношение скоростей реакции к конвективным и диффузионным процессам, соответственно.
     С помощью численного решения получены распределения концентраций компонентов смеси при различных режимах конвекции, выявлены зависимости выхода реакции ПЦР от конвективного и диффузионного чисел Дамкелера, показана пространственная неоднородность полей концентрации компонентов смеси.

Full text file: Volkova.pdf


To reports list
© 1996-2019, Institute of computational technologies of SB RAS, Novosibirsk