Международная конференция
"Современные проблемы математики, информатики и биоинформатики",
посвященная 100-летию со дня рождения члена-корреспондента АН СССР
Алексея Андреевича Ляпунова
№ гос. регистрации - 0321103262, ISBN 978-5-905569-03-6

11 - 14 октября 2011 г., Академгородок, Новосибирск, Россия

Гунбин К.В.   Суслов В.В.   Афонников Д.А.  

Генетическая основа макроэволюционных преобразований: исследование режимов молекулярной эволюции ортологичных белков позвоночных и беспозвоночных

Докладчик: Гунбин К.В.

Создан простой метод анализа режимов эволюции белков, основанный на Марковском моделировании. Используя созданный метод, мы провели анализ режимов эволюции более 2450 ортологичных групп белков (ОГБ) позвоночных и беспозвоночных, полученных из базы данных MetaPhOrs [1]. В результате анализа было показано, что внутренние ветви, содержащие >20% OГБ, имеющих нетипичные, статистически редкие (p<0.01), типы аминокислотных замен, соответствуют основным ароморфозам позвоночных: 1) периодам полногеномных дупликаций при формировании позвоночных и рыб, 2) выходу на сушу, 3) формированию амниот, 4) дивергенции млекопитающих, а также группы плацентарных. Показано, что формирование Insecta и Diptera, сопровождаемое увеличением числа ОГБ с нетипичными аминокислотными заменами, может быть связано с формированием тесного экологического сообщества насекомых и покрытосеменных растений [2]. В настоящей работе также проведен сравнительный анализ функций ОГБ с нетипичными аминокислотными заменами на каждой внутренней ветви дерева позвоночных и беспозвоночных, что позволило связать режимы молекулярной эволюции ОГБ с морфологическими преобразованиями в палеонтологической летописи таксонов Bilateria.