Новосибирск, 18-23 июня 2017 г.

Научная программа

Расписание секций

18 июня - Открытие, Пленарные доклады

19 июня - Белок-НК, НК-НК взаимодействия и трансляция
                NGS и анализ данных

20 июня - Метагеномика, Геномика прокариот и вирусов

21 июня - Геномика растений

22 июня - Палеогеномика
                Геномика животных

23 июня - Медицинская геномика, Закрытие

 

Устные и постерные доклады

19 июня

Белок-НК, НК-НК взаимодействия и трансляция

  • Юлия Каргаполова (Центр молекулярной медицины (Кельн), Германия). A novel crosslinking and immunoprecipitation method reveals the function of CSTF2tau in alternative processing of snRNAs.
  • Дмитрий Грайфер (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Регионы хроматина, ассоциированные с ядрышком, – мишени рибосомного белка uS3, выявленные с помощью метода ChIP-seq
  • Дмитрий Андреев (НИИ Физико-Химической Биологии имени А.Н. Белозерского, МГУ). Рибосомный профайлинг - универсальный инструмент изучения регуляции экспрессии генов
  • Алексей Малыгин (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН)  Исследование функций рибосомных белков человека в регуляции экспрессии генов на уровне трансляции с использованием рибосомного профайлинга
  • Петр Сергиев (МГУ имени М.В. Ломоносова). Применение метода Flowseq для анализа эффективности трансляции библиотек бактериальных мРНК
  • Алексей Белогуров (Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова). Разрушать, чтобы жить: особенности круговорота убиквитина в динамике
  • Анна Кудряева (Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Изучение внутриклеточного метаболизма полиубиквитиновых цепей разного типа ветвления
  • Мирослав Нуриддинов (Институт цитологии и генетики СО РАН). Данные Hi-C Gallus gallus показывают взаимосвязь между свойствами генома и архитектурой хромосом
  • Илья Флямер (University of Edinburgh, Institute of Genetics and Molecular Medicine, MRC HGU). Масштабная реорганизация трёхмерной структуры хроматина при образовании зиготы, выявленная Hi-C на единичных ядрах

NGS и анализ данных

  • Марк Израильсон (Филиал Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Метод всестороннего анализа репертуаров Т-клеточных рецепторов
  • Николай Русских (Новые Программные Системы). Использование машинного обучения для платформы секвенирования нового поколения SeqLL
  • Константин Табаюшев (ИЦиГ СО РАН). Analysis of gene expression related to aggressive behavior on animal models
  • Артур Дергилев (ИЦиГ СО РАН). Analysis of 3D chromosome contacts using sequencing technologies
  • Юрий Букин (Лимнологический институт СО РАН). Процедура тримминга метагеномных данных, полученных путем высокопроизводительного секвенирования ампликонов
  • Ольга Киселева (Научно-исследовательский институт биомедицинской химии им. В.Н. Ореховича). «Мультиомикс» для исследования гетерогенности протеома
  • Федор Колпаков (Институт вычислительных технологий СО РАН). GTRD: база данных по сайтам связывания транскрипционных факторов, идентифицированных при помощи ChIP-seq экспериментов
  • Алла Лапидус (Санкт-Петербургский государственный университет). Task driven conversion of the SPAdes genome assembler into a family of SPAdes tools
  • Михаил Лебедин (Институт Биоорганической Химии им. Шемякина и Овчинникова РАН). Молекулярное баркодирование как средство безошибочного анализа репертуара антител
  • Екатерина Писарева (НИИМББ). Method of library preparation for high sensitive DNA sequencing
  • Анатолий Шлихт  (ДВФУ). Геном-центрированная информационная система анализа и интерпретации омиксных данных человека

20 июня

Метагеномика, Геномика прокариот и вирусов

  • Юрий Галачьянц (Лимнологический институт СО РАН). Метагеномный анализ бактериальных сообществ байкальских губок выявил новые свойства сообществ, ассоциированных с Baikalospongia intermedia Северного Байкала
  • Евгений Андронов (ГНУ Всероссийский институт сельскохозяйственной микробиологии Россельхозакадемии). Эволюционный и адаптационный потенциал почвенного микробиома
  • Туяна Банзаракцаева (Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН). Таксономическое разнообразие протеобактерий в холодном источнике Буксыхен-сердечный (Бурятия)
  • Людмила Руднева (Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН). Метабаркодирование для выявления диеты у даурской пищухи
  • Любовь Глухова (Томский государственный университет). Изучение молекулярных механизмов устойчивости гриба рода Penicillium к высоким концентрациям мышьяка и меди.
  • Ольга Дагурова (Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН). Структура микробного сообщества прибрежной воды озера Байкал
  • Иван Дубовский (Институт систематики и экологии животных СО РАН). Изменение состава микробиоты кишечника при формировании устойчивости насекомых к энтомопатогенным бактериям
  • Иван Егоров (Всероссийский научно-исследовательский и технологический институт птицеводства РАСХН). Изучение зависимостей между структурой микробных сообществ кишечника и активностью  пищеварительных ферментов организма птицы.
  • Илья Никонов (ООО "БИОТРОФ"). Изучение микробиологических особенностей у кур мясных пород в эмбриональный и постэмбриональный периоды
  • Тамара Земская (Лимнологический институт СО РАН). Метагеномный анализ микробных сообществ для исследования цикла метана в озере Байкал
  • Николай Равин (ФИЦ Биотехнологии РАН). Метагеномный анализ экстремальных экосистем для характеристики некультивируемых линий микроорганизмов
  • Виталий Кадников (ФИЦ Биотехнология РАН). Молекулярный анализ микробного сообщества холодного сипа моря Лаптевых, обеспечивающего вовлечение метана в трофические цепи
  • Нина Кулакова (Лимнологический институт СО РАН). Исследование изменений в микробиоме Lubomirskia baicalensis при массовом заболевании байкальских губок
  • Лариса Ильина (ООО "БИОТРОФ"). Определение  микробиоценозов кишечника кур породы «Хайсекс» методом T-RFLP в онтогенезе
  • Елена Лихошвай (Лимнологический институт СО РАН). Перспективы применения NGS для структурно-функциональной характеристики водных экосистем
  • Елена Минчева (Лимнологический институт СО РАН). Метагеномный подход к исследованию цветения нитчатых зеленых водорослей в Байкале: первые результаты.
  • Марсель Кабилов (ИХБФМ СО РАН). Проблемы и перспективы глубокого секвенирования ампликонов на примере 16S рРНК
  • Наталья Наумова (Институт почвоведения  и агрохимии СО РАН). Bacterial 16S DNA diversity in soil under the Korean pine
  • Евгений Олехнович (ФНКЦ Физико-химичесокй медицины ФМБА России). Изучение геномного контекста генов резистентности кишечных микробов при помощи метагеномных данных
  • Елизавета Старикова (ФНКЦ Физико-химичесокй медицины ФМБА России). Анализ фаговых путей распространения генов антибиотикорезистентности с использованием метагеномных данных
  • Елена Эрдынеева (Институт общей и экспериментальной биологии СО РАН). Таксономическое разнообразие микробных сообществ двух соленых озер пустыни Бадаин Жаран (Внутренняя Монголия, Китай)
  • Аксенова Екатерина (ФГБУ «ФНИЦЭМ им. Н.Ф. Гамалеи» Минздрава России). Peculiarities of gram-negative and gram-positive bacteria
  • Татьяна Бутина (Лимнологический институт СО РАН). Метагеномный анализ вирусных сообществ в озере Байкал
  • Алексей Тотменин (ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора). Рекомбинантные варианты ВИЧ-1, циркулирующие в Новосибирской области
  • Алексей Тотменин (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор" Роспотребнадзора). Особенности генетических вариантов ВИЧ-1, выделенных на территории Томской области
  • Александр Ильиных (Институт систематики и экологии животных СО РАН). Определение молекулярных детерминант патогенности  вируса ядерного полиэдроза непарного шелкопряда Lymantria dispar
  • Анна Лемза (ФБУН ГНЦ ВБ "Вектор"). Ретроспективный генетический анализ геномов штаммов вируса натуральной оспы, выделенных во время вспышки оспы 1959-1960 гг. в г. Москва
  • Александр Манолов (ФНКЦ Физико-химичесокй медицины ФМБА России). Поиск генов бактерий вида Escherichia coli ассоциированных с болезнью Крона
  • Константин Мирошников (Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Оценка генетического разнообразия бактериальных патогенов картофеля
  • Мунтян Виктория (ФГБНУ ВНИИСХМ). Внутривидовой сравнительный анализ структуры хромосом клубеньковых бактерий люцерны Sinorhizobium spp.
  • Алла Саксаганская (ФГБНУ ВНИИСХМ). Нуклеотидный анализ генов вирулентности клубеньковых бактерий люцерны
  • Кирилл Мирошников (Института биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Характеристика геномов актуальных штаммов патогенов картофеля Pectobacterium и Dickeya
  • Анна Стенкова (Тихоокеанский институт биоорганической химии им. Г.Б. Елякова Дальневосточного отделения Российской академии наук ). Геномный анализ двух фукоидан-деградирующих альгоассоциированных флавобактерий Formosa algae KMM 3553 и KMM 8021
  • Мария Черкасова (ФГБНУ ВНИИСХМ). Анализ геномного острова Sme19T Sinorhizobium meliloti Rm1021: GC-состав и стабильность внутренней структуры
  • Виктория Штратникова (Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова). Транскриптомный анализ генов стероидного катаболизма у актинобактериального штамма Nocardioides simplex ВКМ Ac-2033Д

21 июня
Геномика растений

  • Добровольская Оксана (Институт цитологии и генетики СО РАН). Ранние этапы развития соцветия пшеницы: изучение генетического контроля и физиологии
  • Валерия Вавилова (Институт цитологии и генетики СО РАН). Установление экзон-интронной структуры гена компактности колоса у ди-, тетра- и гексаплоидных пшениц
  • Анастасия Глаголева (Институт цитологии и генетики СО РАН). RNAseq-based decifering of molecular mechanisms underlying trait formation: non-alternative way in case of impeded metabolite identification
  • Артем Касьянов (Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН). Возникновение ассиметрии регуляторных элементов на ранних стадиях эволюции геномов полиплоидов на примере генома аллотетраплоида Capsella bursa-pastoris
  • Алексей Кочетов (Институт цитологии и генетики СО РАН). Alternative ORFs within eukaryotic mRNAs
  • Виктор Левицкий (Институт цитологии и генетики СО РАН). Компьютерный анализ полногеномных данных указывает на роль типов хроматина в регуляции первичного ответа на этилен у Arabidopsis thaliana
  • Мария Логачева (Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова). Метабаркодинг растений с помощью NGS: обзор возможностей и практический опыт
  • Дарья Новикова (Институт цитологии и генетики СО РАН). Functional annotation of auxin responsive cis-regulatory elements
  • Наталья Нуждина (Центральный сибирский ботанический сад СО РАН). Variation in the internal transcribed spacer (ITS) regions of nuclear ribosomal DNA in endemic Hedysarum species
  • Надежда Омельянчук (Институт цитологии и генетики). Ауксин координирует степень изменения уровня транскрипции генов внутри различных функциональных групп
  • Алексей Пенин (Department of Genetics, Lomonosov Moscow State University.). Ортологизация генов растений с использованием данных детализированных  карт экспрессии.
  • Елена Салина (Институт цитологии и генетики). Сomparative analysis of 5b chromosome rearrangements during wheat evolution based on physical mapping and sequencing data
  • Екатерина Сергеева (Институт цитологии и генетики СО РАН). Детальная организация геномных районов хромосомы 5B мягкой пшеницы, маркированных локусом 5S рДНК
  • Вадим Шаров (Сибирский федеральный университет). Сборка и аннотирование генома лиственницы сибирской
  • Николай Шмаков (Институт цитологии и генетики). Исследование при помощи RNA-seq генов ячменя, контролирующих синтез хлорофилла
  • Анна Щенникова (Институт Биоинженерии, Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" РАН). Гены факторов транскрипции YABBY в транскриптоме микогетеротрофа Monotropa hypopytis
  • Анна Щенникова (Институт Биоинженерии, Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" РАН). Репродуктивное развитие паразитического растения Monotropa hypopytis: транскриптомный анализ MADS-box генов

22 июня

Геномика животных

  • Дарья Андреюшкова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Анализ микродиссекционных библиотек хромосом стерляди (Acipenser ruthenus) с использованием данных высокопроизводительного секвенирования
  • Кира Задесенец (Институт цитологии и генетики СО РАН). Изучение эволюции генома свободноживущего плоского червя Macrostomum lignano (Platyhelminthes, Turbellaria) с помощью высокопроизводительного секвенирования микродиссекционных ДНК-библиотек
  • Денис Ларкин (University of London). Реконструкция и анализ хромосомной организации геномов животных, отсеквенированных с помощью методов высокопроизводительного секвенирования
  • Алексей Макунин (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Высокопроизводительное секвенирование отдельных хромосом
  • Мария Побединцева (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Молекулярная филогения гаплогрупп стерляди Acipenser ruthenus и сибирского осетра A. baerii, основанная на анализе полных митохондриальных геномов
  • Дмитрий Прокопов (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Изучение кариотипа копытного лемминга (Dicrostonyx torquatus) с помощью метода высокопроизводительного секвенирования отдельных хромосом
  • Евгений Журавлев (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Высокопроизводительное секвенирование для анализа функционирования m5C/Ψ-модифицированных аналогов малых ядерных и малых ядрышковых РНК в клетках человека
  • Алёна Степанова (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Исследование транскриптома первичных эндотелиоцитов, культивируемых на поверхности микроволокнистых матриксов разного состава
  • Наталья Стефанова (Институт цитологии и генетики СО РАН). Изменения траскриптома коры мозга при развитии признаков болезни Альцгеймера у крыс OXYS
  • Владимир Трифонов (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН).  Секвенирование и анализ генома и транскриптома стерляди (Acipenser ruthenus)

Палеогеномика

  • Анна Дружкова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Секвенирование митохондриальных геномов древних и современных представителей семейства медвежьи (Ursidae) Западной Сибири
  • Надежда Воробьева (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Сборка полного митохондриального генома лошади Оводова (Equus ovodovi) из Денисовой пещеры
  • Мария Куслий (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Генотипирование древних лошадей археологического памятника Яломан-II
  • Ксения Попова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН). Изучение древней ДНК: митогеномы и В-хромосомы сибирской косули
  • Егор Прохорчук (Институт Биоинженерии, Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" РАН). Сигналы отбора в геноме мамонтов
  • Татьяна Татаринова (ИППИ РАН). Сравнение сравнений: математические методы сравнительного анализа современных и древних последовательностей
  • Храмеева Екатерина Евгеньевна (Сколковский институт науки и технологий). Гены катаболизма липидов обогащены неандертальскими вариантами у современных европейцев

23 июня
Медицинская геномика

  • Артем Артемов (Институт Биоинженерии, Федеральный исследовательский центр "Фундаментальные основы биотехнологии" РАН). Эпигенетические изменения при CRISPR/Cas9 инактивации гена VHL в клетках рака почки
  • Наталья Баулина (Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова). Полнотранскриптомный анализ экспрессии микроРНК в мононуклеарных клетках крови при рассеянном склерозе
  • Анна Бочарова (НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ). Репликативный анализ ассоциаций генетических маркеров болезни Альцгеймера, шизофрении и когнитивных функций с помощью мультиплексного генотипирования методом MALDI-TOF масс-спектрометрии.
  • Игорь Лебедев (НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ). Профилирование экспрессии генов в лимфоцитах индивидов с различной радиочувствительностью
  • Полина Гервас (НИИ онкологии, Томский НИМЦ). Полногеномное секвенирование нативной и фиксированной в формалине опухолевой ткани для идентификации в сравнительном аспекте молекулярно-генетических событий
  • Мария Голубенко (НИИ медицинской генетики, Томский национальный исследовательский медицинский центр Российской академии медицинских наук). Оценка уровня гетероплазмии митохондриальной ДНК при атеросклерозе сонных артерий
  • Мария Гридина (Институт цитологии и генетики СО РАН). Установление границ хромосомных перестроек у пациентов с микроделециями и микродупликациями 3p26.3
  • Евгений Денисов (НИИ онкологии, Томский НИМЦ). Поиск генетических нарушений, ассоциированных с инвазией рака молочной железы: пилотное исследование
  • Евгений Егоров (Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН). Возрастные изменения в структуре Т-клеточных репертуаров
  • Дарья Жигалина (Томский государственный университет). Сравнение эффективности методов NGS и array CGH при детекции хромосомных аберраций у эмбрионов человека на стадии бластоцисты
  • Софья Касацкая (Институт биоорганической химии им. академиков М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова). Клональная селекция адаптивной субпопуляции Vδ1 гамма/дельта лимфоцитов, выявленная по анализу репертуаров Т-клеточных рецепторов наивных гамма/дельта Т-лимфоцитов и Т-клеток памяти
  • Иван Киселев (Российский национальный исследовательский медицинский университет имени Н.И. Пирогова). Полногеномные профили метилирования ДНК в CD4+ и CD14+ клетках больных рассеянным склерозом в зависимости от активности патологического процесса
  • Ольга Кривцова (Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова). Transcriptome-based analysis of allele-specific gene expression in hepatocellular carcinoma
  • Ольга Новикова (Сибирский федеральный биомедицинский исследовательский центр им.ак.Е.Н.Мешалкина"). Поиск генетических маркеров нестабильных атером
  • Никита Литовка (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Структура кольцевых РНК плазмы крови человека
  • Юлия Савиновская (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Влияние экзосом плазмы крови здорового человека на клетки человека in vitro
  • Николай Скрябин (НИИ медицинской генетики Томский НИМЦ). Таргетная оценка индекса метилирования с помощью бисульфитного секвенирования ампликонов
  • Айсен Соловьев (Северо-Восточный федеральный университет им. М.К. Аммосова). Доказательства эффекта основателя по мутации сайта сплайсинга c.-23+1G>A гена GJB2 в некоторых популяциях Евразии по данным полногеномного анализа
  • Евгений Сорокоумов (Институт вычислительных технологий СО РАН). Реконструкция молекулярных взаимодействий аберрантной синаптической пластичности
  • Евгений Журавлев (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН). Роль секретируемых некодирующих РНК в коммуникации между раковыми клетками