Научная программа

Общее расписание конференции:

Программа конференции (PDF)

21 июля

16:00 Открытие конференции (малый зал Дома Ученых)

16:15 Концерт

16:45 Fungal genomics for Energy and Environment. Игорь Григорьев, DOE Joint Genome Institute, США

17:15 Sequencing sample prep and data assembly methods: 15 years of accelerated evolution. Марта Матвиенко, CLC Bio, США
 

22 июля

Геномика эукариот

• Константин Крутовский (Georg-August-University of Göttingen, Германия)
  Targeted and complete genome de novo sequencing in conifer trees with giant and complex genomes
• Matthias Meyer (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Германия)
  Archaic Genomes
• Анча Баранова (George Mason University, USA)
  We know it all: what is next? Protein-centric analysis of publicly available PPI data for functionally diverse KCTD family as an example
• Александр Графодатский (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
  Chromosomal organization of mammalian genomes
• Анна Дружкова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
  Изучение ДНК костных останков рода Equus из Денисовой пещеры с использованием современных платформ для секвенирования
• Алексей Москалев (Институт биологии Коми НЦ УрО РАН, Сыктывкар)
  Изменение транскриптомов имаго Drosophila melanogaster при воздействии гамма-излучений, 2,3,7,8-тетрахлородибензо-p-диоксина, толуола и формальдегида
• Фатима Смагулова (European University of Brittany, Франция)
  Картирование горячих точек рекомбинаци в геноме мышей
• Лосева Екатерина (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
  Функциональная значимость фрагментов генома, генерируемых в результате апоптоза
• Владимир Трифонов (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
  Изучение эволюции половых хромосом рептилий с помощью высокопроизводительного секвенирования хромосомспецифичных библиотек
• Виктория Миронова  (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
  Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней  Arabidopsis thaliana L.
• Дмитрий Алексеев (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
  Геном и транскриптом хиромониды P. Vanderplanki
• Berthold Heinze (Federal Research Centre for Forests, Austria)
  Next-generation alternatives for sequencing many genes in many forest tree individuals
• Юрий Орлов (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
  Computer analysis of 3D chromosome contacts in cell nucleus revealed by high-throughput sequencing: Hi-C and ChIA-PET technologies

23 июля

Метагеномика

• Людмила Чистосердова (University of Washington, США)
  Using Metagenomics for understanding functionality of complex microbial communities
• Евгений Андронов (Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург)
  Новые подходы в анализе почвенной микробиоты по данным высокопризводительного секвенирования ампликонных библиотек.
• Анна Попенко (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
  Особенности микробиоты кишечника российской популяции: функциональный анализ и межнациональное сравнение.
• Александр Зеленин (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
  Структура бактериального сообщества пищеварительного тракта криптобиотической хирономиды Polypedilum vanderplanki с позиции метагеномного анализа.
• Виталий Кадников (Центр "Биоинженерия" РАН, Москва)
  Метагеномный анализ микробного сообщества глубинного подземного термального местообитания в Западной Сибири.
• Александр Тяхт (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
  Метагеномное исследование временной эволюции состава микробиоты кишечника в ходе курса противораковой терапии у детей.
• Борис Коварский (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
  Analysis of genetic variety of human gut metagenome.

Геномика бактерий и вирусов

• Николай Равин (Центр "Биоинженерия" РАН, Москва)
  Секвенирование геномов экстремофильных микроорганизмов - представителей новых филогенетических линий
• Константин Мирошников  (Институт биоорганической химии РАН, Москва)
  Перспективы NextGen секвенирования в геномике бактериофагов
• Ольга Аверина  (Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва)
  Полногеномное секвенирование Bifidobacterium longum GT-15: сравнительный геномный анализ, глобальные регуляторные гены, уникальные гены
• Александр Манолов (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
  Cборка de-novo и сравнительный анализ генома бактерии p. stutzeri kos6, извлеченной из нефтяного шламма
• Иван Бодоев (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
  Секвенирование и de-novo сборка геномной ДНК штамма Neisseria gonorrhoeae k51.05

24 июля

NGS и анализ данных

• Алла Лапидус (ЦГБ СПБГУ, Санкт-Петербург)
  Genome assembly and finishing - why hight quality references are needed
• Андрей Пржибельский (Санкт-Петербургский Академический университет, Санкт-Петербург)
  Genome draft assembly algorithms: from the very beginning till present-day problems
• Marie-Theres Gansauge (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Германия)
  Methods for ancient DNA sequencing
• Елена Кострюкова (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
  Влияние этапа пробоподготовки на результаты метагеномного анализа в формате shotgun-секвенирования
• Игорь Морозов (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
  The importance of library fragments size for the quality of emulsion PCR dependent MPSS data
• Дмитрий Штокало (Институт систем информатики СО РАН, Новосибирск)
  Very long intergenic non-coding RNA (vlincRNA) discovery in NGS data
• Ольга Голосова  (НЦИТ "УНИПРО", Новосибирск)
  Анализ данных высокопроизводительного секвенирования с использованием UGENE.
• Федор Колпаков (Конструкторско-технологический институт вычислительной техники CО РАН, Новосибирск)
  BioUML – software platform for analysis of next generation sequencing data using collaborative and reproducible research
• Денис Дмитриенко (Диаэм, Москва)
  Новые инструменты для создания геномных библиотек
• Дарья Смирнова (Хеликон, Москва)
  Методы высокопроизводительного целевого обогащения участков ДНК для последующего NGS секвенирования

25 июля

Медицинская геномика

• Вадим Степанов (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
  Высокопроизводительное генотипирование SNP: деканализация иммунного ответа при расселении современного человека
• Дмитрий Барякин (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
  Короткие некодирующие РНК плазмы крови человека
• Анна Савельева (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
  Состав рибонуклеиновых кислот внеклеточных везикул крови здорового человека.
• Екатерина Трифонова (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
  Выявление патофизиологических механизмов преэклампсии методом полногеномного анализа экспрессии
• Мария Назаренко (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
  Использование микрочиповых технологий для оценки уровня метилирования ДНК тканей сосудистой стенки и лейкоцитов периферической крови у больных атеросклерозом
• Ольга Сайк  (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
  Анализ численной экспрессии генов по данным RNA-Seq для расширения "ассоциома" заболевания, реконструированного на основе информации из баз данных.
• Florian Graedler  (Illumina, Netherlands)
  From Cancer to NIPT - NGS technology in clinical applications.
• Павел Натальин (Life Technologies, Москва)
  Высокопроизводительное секвенирование для фундаментальной науки и медицины