Научная программа
Общее расписание конференции:
|
21 июля |
22 июля |
23 июля |
24 июля |
25 июля |
Утро |
|
Геномика эукариот
(9:00)
|
Метагеномика
(9:00)
|
NGS и анализ данных
(9:00)
----------------------------
Постерная сессия
|
Медицинская геномика
(9:00)
------------------
Закрытие
|
После обеда |
Открытие
(16:00)
|
Геномика бактерий и вирусов |
|
Культурная программа |
Банкет
(19:00)
|
Зоопарк |
Балет |
Геологический музей
Фуршет
|
|
Программа конференции (PDF)
21 июля
16:00 Открытие конференции (малый зал Дома Ученых)
16:15 Концерт
16:45 Fungal genomics for Energy and Environment. Игорь Григорьев, DOE Joint Genome Institute, США
17:15 Sequencing sample prep and data assembly methods: 15 years of accelerated evolution. Марта Матвиенко, CLC Bio, США
22 июля
Геномика эукариот
-
Константин Крутовский (Georg-August-University of Göttingen, Германия)
Targeted and complete genome de novo sequencing in conifer trees with giant and complex genomes
-
Matthias Meyer (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Германия)
Archaic Genomes
-
Анча Баранова (George Mason University, USA)
We know it all: what is next? Protein-centric analysis of publicly available PPI data for functionally diverse KCTD family as an example
-
Александр Графодатский (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
Chromosomal organization of mammalian genomes
-
Анна Дружкова (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
Изучение ДНК костных останков рода Equus из Денисовой пещеры с использованием современных платформ для секвенирования
-
Алексей Москалев (Институт биологии Коми НЦ УрО РАН, Сыктывкар)
Изменение транскриптомов имаго Drosophila melanogaster при воздействии гамма-излучений, 2,3,7,8-тетрахлородибензо-p-диоксина, толуола и формальдегида
-
Фатима Смагулова (European University of Brittany, Франция)
Картирование горячих точек рекомбинаци в геноме мышей
-
Лосева Екатерина (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
Функциональная значимость фрагментов генома, генерируемых в результате апоптоза
-
Владимир Трифонов (Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск)
Изучение эволюции половых хромосом рептилий с помощью высокопроизводительного секвенирования хромосомспецифичных библиотек
-
Виктория Миронова (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
Ауксин-зависимые изменения транскриптома корней Arabidopsis thaliana L.
-
Дмитрий Алексеев (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Геном и транскриптом хиромониды P. Vanderplanki
-
Berthold Heinze (Federal Research Centre for Forests, Austria)
Next-generation alternatives for sequencing many genes in many forest tree individuals
-
Юрий Орлов (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
Computer analysis of 3D chromosome contacts in cell nucleus revealed by high-throughput sequencing: Hi-C and ChIA-PET technologies
23 июля
Метагеномика
-
Людмила Чистосердова (University of Washington, США)
Using Metagenomics for understanding functionality of complex microbial communities
-
Евгений Андронов (Всероссийский НИИ сельскохозяйственной микробиологии, Санкт-Петербург)
Новые подходы в анализе почвенной микробиоты по данным высокопризводительного секвенирования ампликонных библиотек.
-
Анна Попенко (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Особенности микробиоты кишечника российской популяции: функциональный анализ и межнациональное сравнение.
-
Александр Зеленин (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Структура бактериального сообщества пищеварительного тракта криптобиотической хирономиды Polypedilum vanderplanki с позиции метагеномного анализа.
-
Виталий Кадников (Центр "Биоинженерия" РАН, Москва)
Метагеномный анализ микробного сообщества глубинного подземного термального местообитания в Западной Сибири.
-
Александр Тяхт (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Метагеномное исследование временной эволюции состава микробиоты кишечника в ходе курса противораковой терапии у детей.
-
Борис Коварский (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Analysis of genetic variety of human gut metagenome.
Геномика бактерий и вирусов
-
Николай Равин (Центр "Биоинженерия" РАН, Москва)
Секвенирование геномов экстремофильных микроорганизмов - представителей новых филогенетических линий
-
Константин Мирошников (Институт биоорганической химии РАН, Москва)
Перспективы NextGen секвенирования в геномике бактериофагов
-
Ольга Аверина (Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва)
Полногеномное секвенирование Bifidobacterium longum GT-15: сравнительный геномный анализ, глобальные регуляторные гены, уникальные гены
-
Александр Манолов (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Cборка de-novo и сравнительный анализ генома бактерии p. stutzeri kos6, извлеченной из нефтяного шламма
-
Иван Бодоев (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Секвенирование и de-novo сборка геномной ДНК штамма Neisseria gonorrhoeae k51.05
24 июля
NGS и анализ данных
-
Алла Лапидус (ЦГБ СПБГУ, Санкт-Петербург)
Genome assembly and finishing - why hight quality references are needed
-
Андрей Пржибельский (Санкт-Петербургский Академический университет, Санкт-Петербург)
Genome draft assembly algorithms: from the very beginning till present-day problems
-
Marie-Theres Gansauge (Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology, Германия)
Methods for ancient DNA sequencing
-
Елена Кострюкова (НИИ Физико-химической медицины ФМБА, Москва)
Влияние этапа пробоподготовки на результаты метагеномного анализа в формате shotgun-секвенирования
-
Игорь Морозов (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
The importance of library fragments size for the quality of emulsion PCR dependent MPSS data
-
Дмитрий Штокало (Институт систем информатики СО РАН, Новосибирск)
Very long intergenic non-coding RNA (vlincRNA) discovery in NGS data
-
Ольга Голосова (НЦИТ "УНИПРО", Новосибирск)
Анализ данных высокопроизводительного секвенирования с использованием UGENE.
-
Федор Колпаков (Конструкторско-технологический институт вычислительной техники CО РАН, Новосибирск)
BioUML – software platform for analysis of next generation sequencing data using collaborative and reproducible research
-
Денис Дмитриенко (Диаэм, Москва)
Новые инструменты для создания геномных библиотек
-
Дарья Смирнова (Хеликон, Москва)
Методы высокопроизводительного целевого обогащения участков ДНК для последующего NGS секвенирования
25 июля
Медицинская геномика
-
Вадим Степанов (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
Высокопроизводительное генотипирование SNP: деканализация иммунного ответа при расселении современного человека
-
Дмитрий Барякин (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
Короткие некодирующие РНК плазмы крови человека
-
Анна Савельева (Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, Новосибирск)
Состав рибонуклеиновых кислот внеклеточных везикул крови здорового человека.
-
Екатерина Трифонова (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
Выявление патофизиологических механизмов преэклампсии методом полногеномного анализа экспрессии
-
Мария Назаренко (НИИ медицинской генетики СО РАМН, Томск)
Использование микрочиповых технологий для оценки уровня метилирования ДНК тканей сосудистой стенки и лейкоцитов периферической крови у больных атеросклерозом
-
Ольга Сайк (Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск)
Анализ численной экспрессии генов по данным RNA-Seq для расширения "ассоциома" заболевания, реконструированного на основе информации из баз данных.
-
Florian Graedler (Illumina, Netherlands)
From Cancer to NIPT - NGS technology in clinical applications.
-
Павел Натальин (Life Technologies, Москва)
Высокопроизводительное секвенирование для фундаментальной науки и медицины